よく使う環境変数をTerminal起動時に自動的に設定するようにしたい時は，.bachrcという設定ファイルを編集します．
Mas OSではTerminal起動時に
~/.bash_profile
というファイルの中身が実行されます．この中身は例えば次のようになっています
if [ -f ~/.bashrc ] ; then
. ~/.bashrc
fi
~/.bachrcが存在すれば，それを実行するというだけの単純な内容です．設定の詳細はこの.bashrcに記述します．もし.bashrcが存在しなければ新規に作成しましょう．
例えば，.bashrcに
export ROOTSYS=/usr/local/opt/root6
と書き込むことで，Terminal起動時にROOTSYSという環境変数を設定できます．
.bashrcを編集した時，その内容を即座に反映させたい場合は
source ~/.bashrc
とします．